ญี่ปุ่นเข้าอยู่ยุคใหม่ บริษัทเทคโนโลยีล้ำหน้าอย่างฮิเด็นได้สร้างปัญญาประดิษฐ์ในรูปแบบคนที่เรียกว่าฮิวมาเกียร์ขึ้นมา ฮิเด็น อารุโตะ หนุ่มน้อยที่มีความฝันจะเป็นนักแสดงตลก ต้องมารับสืบทอดกิจการของปู่ และยังได้รับเซโร่วันไดรเวอร์ เพื่อแปลงร่างเป็นมาสค์ไรเดอร์ซีโร่วันและพบว่าเขาต้องเข้ามาอยู่ระหว่างการต่อสู้ของ MetsubouJinrai.net และ ZAIA Japan ซึ่งต้องการกวาดล้างฮิวมาเกียร์ให้ออกไปจากโลกมนุษย์และขึ้นครองโลก